Vakıf Yönetim Kurulu, en yüksek karar organı olup, kendi aralarından seçtiği başkan, başkan yardımcısı ve genel sekreterden oluşan İcra Komitesi vasıtasiyla, Feyziye Mektepleri Vakfı ve FMV Işık Okulları’nı yönetmektedir.

Ayrıca Yönetim Kurulu Üyelerinden oluşan Mali Murakebe Heyeti, Feyziye Mektepleri Vakfı ve FMV Işık Okulları ile ilgili eğitim, teknik ve mali konularda gerekli gördüğü inceleme ve denetimleri yapmakta, ileriye dönük kısa, orta ve uzun vadeli aldığı kararları uygulatmakta veya gerektiğinde Yönetim Kurulu gündemine getirmektedir.